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中国沙漠, 2022, 42(2): 85-94 doi: 10.7522/j.issn.1000-694X.2021.00105

不同生物气候区生物土壤结皮蓝藻物种多样性

闫沛迎,1, 屈建军2, 杨自辉1, 肖建华2, 唐进年,1

1.甘肃省治沙研究所 民勤荒漠草地生态系统国家野外科学观测研究站,甘肃 民勤 730070

2.中国科学院西北生态环境资源研究院 敦煌戈壁荒漠生态与环境研究站/沙漠与沙漠化重点实验室,甘肃 兰州 730000

Cyanobacterial diversity of biological soil crusts in different bioclimatic regions in China

Yan Peiying,1, Qu Jianjun2, Yang Zihui1, Xiao Jianhua2, Tang Jinnian,1

1.Minqin National Studies Station for Desert Steppe Ecosystem,Gansu Desert Control Research Institute,Lanzhou 730070,China

2.Dunhuang Gobi and Desert Ecology and Environment Research Station / Key Laboratory of Desert and Desertification,Northwest Institute of Eco-Environment and Resources,Chinese Academy of Sciences,Lanzhou 730000,China

通讯作者: 唐进年(E-mail: tangjngs@126.com

收稿日期: 2021-01-07   修回日期: 2021-08-25  

基金资助: 国家重点研发计划项目.  2017YFC0504804
中国科学院沙漠与沙漠化重点实验室开放基金项目.  KLDD-2019-007
甘肃省荒漠化与风沙灾害防治重点实验室开放基金项目.  GSDC201904
甘肃省重点研发计划项目.  21YF5FA037

Received: 2021-01-07   Revised: 2021-08-25  

作者简介 About authors

闫沛迎(1980—),女,甘肃景泰人,博士,副研究员,主要从事荒漠区生物土壤结皮研究E-mail:YPY_1980@lzb.ac.cn , E-mail:YPY_1980@lzb.ac.cn

摘要

丝状蓝藻作为荒漠区的先锋拓殖生物,在干旱半干旱的生物地球化学循环和生态修复过程中发挥着重要作用。本研究对3个不同生物气候区(民勤,大陆性荒漠气候;盐池,中温带大陆性气候;玛曲,高原大陆性气候)藻结皮中培养分离到的67株丝状蓝藻进行丝体的形态描述和16s rRNA分子鉴定。结果表明:67株丝状蓝藻隶属于颤藻目(Oscillatoriales)、聚球藻目(Synechococcales)和念珠藻目(Nostocales);3个生物气候区的蓝藻群落组成存在差异;具鞘微鞘藻(Microcoleus vaginatus)为3个不同生物气候区的共有藻;玛曲和民勤没有共有蓝藻属;微鞘藻属(Microcoleus)和颤藻属(Oscillatoria)是民勤和盐池的共有蓝藻属;玛曲和盐池只有Nodosilinea共有蓝藻属。在3个生物气候区的藻结皮中,只在玛曲培养分离到固氮蓝藻(Calothrix desertica),而在其他2个区未分离到。

关键词: 丝状蓝藻 ; 多样性 ; 生物土壤结皮 ; 生物气候区

Abstract

Filamentous cyanobacteria, as pioneer colonizers in desert areas, play an important role in the biogeochemical cycle and ecological restoration of arid and semi-arid areas. In this paper, sixty-seven filamentous cyanobacteria were isolated from the cyanobacterial crusts in three different bioclimatic regions. The results showed that sixty-seven filamentous cyanobacteria belonged to Oscillatorles, Siaynechococcales and Nostocale. The community compositions of cyanobacteria in the three bioclimatic regions were different. Microcoleus vaginatus was a common cyanobacterium in three different bioclimatic regions. There was no common cyanobacterium in Maqu and Minqin except Microcoleus vaginatus. Microcoleus and Oscillatoria were common cyanobacterial genera in Minqin and Yanchi. Only members of Nodosilinea were found in Maqu and Yanchi. Among the cyanobacterial crusts in three bioclimatic regions, Calothrix desertica was isolated only from Maqu, not from the other two regions.

Keywords: filamentous cyanobacteria ; diversity ; biological soil crusts ; bioclimatic regions

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本文引用格式

闫沛迎, 屈建军, 杨自辉, 肖建华, 唐进年. 不同生物气候区生物土壤结皮蓝藻物种多样性. 中国沙漠[J], 2022, 42(2): 85-94 doi:10.7522/j.issn.1000-694X.2021.00105

Yan Peiying, Qu Jianjun, Yang Zihui, Xiao Jianhua, Tang Jinnian. Cyanobacterial diversity of biological soil crusts in different bioclimatic regions in China. Journal of Desert Research[J], 2022, 42(2): 85-94 doi:10.7522/j.issn.1000-694X.2021.00105

0 引言

生物土壤结皮(Biological Soil Crusts, BSCs)是由隐花植物如蓝藻、绿藻、地衣、藓类和微生物及相关的其他生物体通过菌丝体、假根和分泌物等与表层土壤颗粒“胶结”而形成的具有独特结构和功能的地表生物覆盖体,是荒漠系统中联结生物与非生物因素的“生态系统工程师”,它的存在被认为是健康生态系统的重要标志1。目前,BSCs约占陆地面积的12%,主要分布在植被稀疏的干旱半干旱区2。BSCs在不同生物气候区的荒漠景观过程3、土壤生态过程4、土壤水文过程5、土壤生物过程和地球化学循环过程6-7,以及干旱半干旱地区生态修复过程中发挥着重要作用8。因此,BSCs的研究是地学和生物学学科交叉的前沿研究领域,已成为国际干旱区地表过程研究的重要核心科学问题。

蓝藻是BSCs的先锋拓殖生物,譬如Microcoleus、裂须藻属(Schizothrix)和Coleofasciculus等属的丝状蓝藻与细菌不同,它们可以通过光能将CO2合成为自身需要的有机物,它们还可以向体外分泌以多糖为主的物质,从而黏结土壤颗粒和沙粒,形成早期的BSCs9-11。BSCs成熟期的伪枝藻属(Scytonema)、单歧藻属(Tolypothrix)和念珠藻属(Nostoc)除有固氮能力外,还可以产生色素和胞外多糖抵御荒漠区的强辐射,从而提高BSCs的生存能力和促进其发育进程212-13。随着分子生物技术快速的发展,利用非培养的扩增子和宏基因组技术可以更深入地揭示BSCs中蓝藻群落结构特征14-15,培养BSCs中的蓝藻群落也成为研究其生物学功能和获得人工蓝藻结皮构建中藻种组合的首要任务。本研究通过培养玛曲、民勤和盐池藻结皮中丝状蓝藻群落,旨在揭示不同气候生物区可培养丝状蓝藻的群落结构差异,同时也为荒漠化治理提供不同生境的藻种。

1 研究区与方法

1.1 研究区状况

研究样地位于宁夏盐池毛乌素沙地生态系统国家定位观测研究站、玛曲县沙化草原综合治理示范区和甘肃民勤荒漠草地生态系统国家野外科学观测研究站(表1图1)。

表1   采样地概况

Table 1  Conditions of sampling sites

样地气候类型经纬度海拔 /m年降 水量 /mm年蒸 发量 /mm年均 气温 /℃土壤 类型主要植被
民勤大陆性荒漠气候38°35′01″N,102°58′16″E1 3911172 3527.7黏沙土红砂、白刺、油蒿;猪毛菜、盐生草、五星蒿、画眉草
盐池中温带大陆性气候37°42′31″N,107°13′37″E1 5302922 0248.3风沙土油蒿、杨柴、沙柳、花棒;赖草、白草、沙生针茅
玛曲高原大陆性气候34°00′39″N,102°09′30″E3 4466161 3531.1沙质土褐鳞苔草、粗壮嵩草、赖草、垂穗披碱草

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图1

图1   研究区位置(MIN:民勤采样点;YAN:盐池采样点;MA:玛曲采样点)16

Fig.1   Sampling map (MIN: sampling site in Minqin; YAN: sampling site in Yanchi; MA: sampling site in Maqu)16


1.2 样品采集

样品的采集于2017年8月进行。选取BSCs发育主要是藻阶段的样地,在样地内用无菌铲将藻结皮层从土壤表面剥离装入无菌的封口袋,尽快运回实验室进行分离培养。

1.3 藻种的分离培养

将采集的藻结皮约5 g左右放入盛有30 mL BG11液体培养基的50 mL锥形瓶中,放置在摇床中震荡45 min后静置30 min,然后在超净工作台上吸取100 uL上清液涂布于BG11和BG110固体平板培养基上,将平板放置于温度为28 ℃、光照3 000 lux的光照培养箱中12 h照/12 h暗进行培养。待培养大约2个月后,固体培养基上呈现出形态不相同的藻落, 然后用BG11和BG110固体培养基将各个藻落进行分离纯化。将纯化的藻落制片在显微镜(Olympus,CX31)40倍或100倍视野下对藻丝进行照相和进行后续的分子鉴定。

1.4 DNA提取

将分离纯化的藻株刮取收集到已灭菌的研钵中,加入一定量的液氮研磨,将研磨碎的蓝藻加入到细菌基因组DNA提取试剂盒的离心管中,按照试剂盒的提取步骤进行提取。

1.5 PCR扩增与测序

PCR引物为8-27f(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1507-1492r(5′-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3′)。扩增体系:1×PCR缓冲液(MBI),2.5 mM MgCl2(MBI),正反向引物各0.2 μM,0.2 mM dNTP,1U Taq DNA 聚合酶(MBI),1 μL上述细胞裂解液用作DNA模板,总反应体系25 μL。同时用无菌去离子水代替DNA模板用作PCR反应的阴性对照。扩增条件:94 ℃下预变性1 min;94 ℃下变性1 min,复性温度58 ℃下1 min,72 ℃下延伸1.5 min,共30个循环;72 ℃下延伸10 min。PCR产物用1.0%(wt/vol)琼脂糖凝胶电泳检测。

将扩增片段送往上海美吉测序公司测序,将测序所获得的序列与Genbank NCBI Blast(http://www.ncbi.nlm. nib.gov/blast/blast.cgi)序列数据库的SSU rRNA序列进行匹配,根据最相似序列确定其系统发育地位。

2 结果与分析

2.1 蓝藻的形态学特征

根据丝状蓝藻在BG11和BG110平板上的藻落形态特征,将玛曲、民勤和盐池藻结皮中分离培养出的丝状蓝藻挑取67株进行纯化,然后对其进行光学显微镜观察和拍照,玛曲9种丝状蓝藻的形态特征见图2表2,民勤9种丝状蓝藻的形态特征见图3表3,盐池10种丝状蓝藻的形态特征见图4表4)。

图2

图2   玛曲BSCs蓝藻藻丝显微图

Fig.2   Microscopic picture of cyanobacterial filaments from BSCs in Maqu


表2   玛曲BSCs可培养蓝藻群落组成

Table 2  Community composition of culturable cyanobacteria from BSCs in Maqu

藻株 编号所属蓝藻目藻丝形态相似藻(登录号)相似度 /%相似藻 来源
MA2颤藻目 (Oscillatoriales)藻丝体较宽,成束,鞘厚,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端细胞扁圆柱形Ancylothrix terrestris(NR_149292)99.5土壤
MA4藻丝较宽,成束,鞘厚,细胞近方形,横壁不收缢;具帽状体Microcoleus vaginatus(EF654078)99.8土壤
MA15藻丝较细,弯曲缠绕,鞘薄,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端不渐细Phormidium sp. SAG (EU624415)99.1土壤
MA5聚球藻目 (Synechococcales)藻丝较细,群聚成簇,鞘薄,横壁收缢,末端不渐细Leptolyngbya margaretheana(FR798934)98.5生物膜
MA11藻丝较细,群集成簇,部分成螺旋状,具有结节,鞘薄,横壁收缢,末端细胞头状Nodosilinea sp. ACSSI (MT425934)99.6黑钙土
MA20藻丝较细,弯曲,群集成簇,鞘薄,细胞圆柱形,横壁收缢,末端不渐细Uncultured cyanobacterium clone (HQ189074)99.2高山土壤
MA1念珠藻目 (Nostocales)藻丝体较宽,弯曲缠绕,鞘厚,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端渐细Nostoc sp. FI5-VF5 clone (MH427695)96.3土壤
MA17藻丝宽,较长,群集成簇,不分枝,鞘薄,横壁收缢,异形胞基生,呈半球形Calothrix desertica(AF132779)99.3沙粒
MAN3藻丝较宽,较短,群集成簇,不分枝,鞘薄,横壁收缢,异形胞基生,呈半球形Calothrix desertica(AF132779)98.8沙粒

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图3

图3   民勤BSCs蓝藻藻丝显微图

Fig.3   Microscopic picture of cyanobacterial filaments from BSCs in Minqin


表3   民勤BSCs可培养蓝藻群落组成

Table 3  Community composition of culturable cyanobacteria from BSCs in Minqin

藻株编号所属蓝藻目藻丝形态相似藻(登录号)相似度/%相似藻来源
MIN1颤藻目 (Oscillatoriales)藻丝较宽,成束,鞘厚,细胞近方形,横壁不收缢,具帽状体Microcoleus vaginatus(MW403933)99.9BSCs
MIN2藻丝较宽,扭曲成团,鞘薄,细胞短柱形,横壁不收缢,末端渐细Oscillatoria sp. WY04 (MG874712)99.1水稻
MIN3藻丝较宽,成束,鞘厚,细胞短圆柱形,横壁不收缢,末端细胞钝圆锥形Microcoleus sp. PCC 7113 (CP003632)98.2土壤
MIN6藻丝较宽,弯曲,鞘厚,细胞近方形,横壁不收缢,有颗粒,末端细胞多样Tychonema sp. SAG (KM019964)99.4土壤
MIN8藻丝较宽,成束,鞘厚,细胞短圆柱形,横壁不收缢,有颗粒,末端细胞渐细Microcoleus steenstrupii(MG641920)99.3BSCs
MIN9藻丝较宽,弯曲缠绕,鞘厚,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端细胞圆锥形Uncultured bacterium clone (FJ230813)97.6矿泥
MIN18藻丝较细,群集成簇,鞘薄,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端不渐细Microcoleus sp. LSB13 clone (MW403938)99.1BSCs
MIN23藻丝较宽,群集成簇,鞘厚,细胞近方形,横壁不收缢,端不渐细Phormidesmis sp. ACSSI (KY283068)98.9土壤
MIN4聚球藻目 (Synechococcales)藻丝较细,弯曲成簇,鞘薄,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端细胞头状Oculatella atacamensis(MK248001)99.4BSCs

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图4

图4   盐池BSCs蓝藻藻丝显微图

Fig.4   Microscopic picture of cyanobacterial filaments from BSCs in Yanchi


表4   盐池BSCs可培养蓝藻群落组成

Table 4  Community composition of culturable cyanobacteria from BSCs in Yanchi

藻株 编号所属蓝藻目藻丝形态相似藻(登录号)相似度 /%相似藻 来源
YAN2颤藻目 (Oscillatoriales)藻丝较宽,成束,鞘厚,细胞圆柱形,横壁不收缢,有颗粒,具帽状体Microcoleus sp. LSB13 clone (MW403938)99.6BSCs
YAN3藻丝较宽,扭曲成绳状,鞘厚,细胞短圆柱形,横壁不收缢,具帽状体Microcoleus cf. vaginatus (MH688845)99.6BSCs
YAN4藻丝宽,弯曲,鞘薄,细胞短圆柱形,横壁不收缢,有颗粒,末端不渐细Coleofasciculus chthonoplastes(KC463190)98.9BSCs
YAN16藻丝宽,弯曲,鞘薄,细胞短圆柱形,横壁不收缢,末端不渐细Oscillatoria sp. WY04 (MG874712)99.3水稻
YAN19藻丝较宽,弯曲缠绕,鞘厚,细胞圆柱形,横壁收缢,末端不渐细Microcoleus sp. ACSSI (MT425931)99.4黑钙土
YAN22藻丝较宽,群集成团,鞘薄,细胞圆柱形,横壁不收缢,末端细胞圆锥形Oscillatoriales cyanobacterium (MT664819)99.9BSCs
YAN5聚球藻目 (Synechococcales)藻丝较细,群集成团,部分螺旋状,鞘薄,细胞短圆柱形,横壁不收缢,末端细胞头状Uncultured cyanobacterium clone (EU255707)97.2

微生

物垫

YAN8藻丝较宽,弯曲缠绕,鞘厚,细胞圆柱形,横壁收缢,末端细胞钝圆锥形Nodosilinea epilithica(KY283051)99.3土壤
YAN9藻丝较细,群集成团,鞘薄,细胞圆柱形,横壁收缢,末端细胞头状Pseudophormidium sp. WJT61-NPBG13 (KJ939055)99.4荒漠土
YAN20藻丝较细,呈波浪形弯曲,鞘薄,细胞圆柱形,横壁收缢,末端细胞头状Nodosilinea sp. ACSSI (MT425934)99.6黑钙土

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2.2 蓝藻的16S rRNA系统发育

对纯化出的67株丝状蓝藻进行16s rRNA分子鉴定,它们为隶属于颤藻目(Oscillatoriales),聚球目(Synechococcales)和念珠藻目(Nostocales)的28种蓝藻。

在高寒区玛曲藻结皮中分离到的9种丝状蓝藻的系统发育树显示(表2图5),其中3种与Oscillatoriales中的Microcoleus,AncylothrixPhormidium(席藻属)的蓝藻相似度均在99%以上;2种与Synechococcales中Leptolyngbya(瘦鞘丝藻属)和Nodosilinea的蓝藻相似度在98%以上;MA20与最相似蓝藻克隆的相似度在99%以上,其次与Synechococcales中Leptolyngbya的蓝藻相似仅96%,MA1与Nostoc的蓝藻克隆的相似度仅有96%,因此,MA20和MA1很可能是未鉴定分类的新藻种。同时,在含氮BG11和无氮BG110平板上都培养分离到具有异形胞的固氮眉藻(Calothrix desertica),但它们的丝体形态各异,相对BG110平板上培养出的眉藻,BG11上的丝状体体积更大。9种丝状蓝藻中接近90%的与源于土壤的蓝藻相似。

图5

图5   玛曲BSCs蓝藻16S rDNA系统发育树

Fig.5   Phylogenetic tree of cyanobacteria from BSCs in Maqu based on 16S rDNA sequences


从典型干旱区的民勤藻结皮中分离到9种丝状蓝藻,但未分离到固氮蓝藻。图6系统发育树和表3显示,其中7种与Oscillatoriales中MicrocoleusOscillatoriaTychonema(常丝藻属)和Phormidesmis的蓝藻相似,且相似均在98%以上;Min9与不可培养细菌克隆相似度97%以上,与不可培养Microcoleus蓝藻相似度仅有94%,它很可能是未鉴定分类的新藻种;Min4与Synechococcales的Oculatella atacamensis相似度在99%以上。9种丝状蓝藻中接近90%的与源于土壤的蓝藻相似。

图6

图6   民勤BSCs蓝藻16S rDNA系统发育树

Fig.6   Phylogenetic tree of cyanobacteria from BSCs in Minqin based on 16S rDNA sequences


从半干旱盐池藻结皮中分离到10种丝状蓝藻,未分离到固氮蓝藻。图7系统发育树和表4显示,其中5种与Oscillatoriales中的MicrocoleusColeofasciculusOscillatoria的蓝藻相似度在98%以上;Yan22与颤藻目蓝藻相似度接近100%;3种与Synechococcales中的NodosilineaPseudophormidium的蓝藻相似度在99%以上,Yan5与Synechococcales的不可培养的蓝藻克隆相似度达97%,与已鉴定的蓝藻种相似度小于97%,它很可能是未鉴定分类的新藻种。10种丝状蓝藻中接近80%与源于土壤的蓝藻相似。

图7

图7   盐池BSCs蓝藻16S rDNA系统发育树

Fig.7   Phylogenetic tree of cyanobacteria from BSCs in Yanchi based on 16S rDNA sequences


2.3 不同气候区生物结皮蓝藻物种组成特征

在3个不同生物气候区培养分离到的丝状蓝藻种类数接近,但群落组成存在差异(图8)。其中,Microcoleus vaginatus是玛曲、民勤和盐池藻结皮中的共有蓝藻;未分离到只属于玛曲和民勤藻结皮共有蓝藻属;MicrocoleusOscillatoria是只属于民勤和盐池藻结皮的共有蓝藻属,Nodosilinea是只属于玛曲和盐池藻结皮的共有蓝藻属。同时,Ancylothrix terrestrisC. deserticaLeptolyngbya margareth-eanaPhormidium sp.相似藻和2种未分类藻是玛曲藻结皮独有藻;O. atacamensisMicrocoleus steenstrupiiTychonema sp.、Phormidesmis sp.相似藻和1种未分类藻是民勤藻结皮独有藻;Coleofasciculus chthonoplastesPseudophormidium sp.、Oscillatoriales相似藻和1种未分类藻是盐池藻结皮独有藻。我们只有在玛曲分离到了固氮蓝藻(C. desertica),而在其他2个区未分离到。

图8

图8   3个生物气候区丝状蓝藻的韦恩图

Fig.8   Venn of filamentous cyanobacteria in three bioclimatic regions


3 结论与讨论

Microcoleus是3个不同生物气候区共有的蓝藻属。Zhou等17利用扩增子测序发现Microcoleus是毛乌素沙地藻结皮中的关键蓝藻属,本研究同样利用扩增子测序发现Microcoleus也是沙坡头不同恢复年代BSCs中蓝藻群落的优势属(未发表)。Microcoleus属蓝藻之所以分布广18-19,很可能由于面对荒漠区的强辐射,Microcoleus属蓝藻群落可以移动到地面以下隐藏,当地面足够潮湿时再返回地表进行光合作用20-21,它们还可以利用多糖鞘抵御干旱22。Garcia-Pichel等23发现M.vaginatus适应低温,而M. steenstrupii适应气温相对较高的生境。而Hagemann等24发现M. vaginatus相似藻适应比较高温和干旱的生境。在玛曲、民勤和盐池藻结皮中都分离到M. vaginatus,而只在民勤分离到了M. steenstrupii,这很可能是前者的生态位比后者宽的缘故。

在玛曲藻结皮中分离到了固氮蓝藻(C. desertica),而在其他2个生物气候区未分离到固氮蓝藻。正如Weber等14的研究结果,固氮蓝藻主要分布在BSCs的成熟阶段(地衣阶段和苔藓阶段),而我们只在藻结皮中进行了培养和分离。目前就固氮蓝藻,对于ScytonemaNostoc(念珠藻属)的报道较多,它们主要分布干旱区,在潮湿的高山地区未发现25-26,这是由于它们对于水分受限具有抵御能力,而对于高海拔的低温没有耐受性27,我们不但在玛曲分离到C. desertica,而且在青海沙珠玉植被恢复的BSCs中也分离到C. desertica(未发表),这说明它很可能是高寒区BSCs中的关键固氮藻。

3个不同生物气候区藻结皮分离到的蓝藻主要隶属于Oscillatoriales和Synechococcales,这与Pushkareva等28利用扩增子测序对北极蓝藻结皮中蓝藻群落的研究结果一致。除了Microcoleus以外,LeptolyngbyaPhormidesmis属蓝藻分布较广29-30,这很可能与它们具有较高的抗旱和耐高温能力有关24。我们不但在干旱区和高寒区都分离到这2个属的蓝藻,Pushkareva等28在北极也恢复出LeptolyngbyaPhormidesmis的蓝藻,说明这2个属的蓝藻还具有耐低温的抗逆性。Perkerson等31在分子水平将NodosilineaLeptolyngbya分离出来,因此,它们的藻丝形态十分相似。在目前利用人工藻结皮抵御荒漠化的过程中,除了选用M. vaginatusScytonema javanicum作为藻种以外,还考虑选用LeptolyngbyaPhormidesmis属的蓝藻种。

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