科尔沁沙地典型植物对增温响应的基因差异表达

史尚彬, 黄文达, 于海伦, 冯静, 朱远忠

Differential gene expression response to warming of typical plants in the Horqin Sandy Land

Shangbin Shi, Wenda Huang, Hailun Yu, Jing Feng, Yuanzhong Zhu

表1 转录组测序结果质量

Table 1 Quality of transcriptome sequencing results

测序与组装 沙地榆 小叶杨 差不嘎蒿 小叶锦鸡儿 狗尾草 猪毛蒿 测序 原始读取序列 321 136 994 324 719 284 310 110 492 261 751 624 358 693 606 305 014 366 纯净读取序列 318 488 970 323 126 762 308 115 426 259 855 420 354 927 030 303 108 758 组装 总拼接序列数 136 627 781 138 875 218 126 720 960 108 394 090 154 755 008 117 345 863 Transcript数 115 841 120 677 212 077 208 434 145 595 274 136 Unigene数 66 063 68 736 111 514 125 792 103 087 141 709 GC比例/% 40.43 40.08 39.33 40.37 47.97 39.04 N50长度/bp 1 575 1 763 1 051 1 096 1 369 1 049 平均长度/bp 820.29 907.92 670.02 715.59 754.94 726.26